Основными целями, предусмотренными Уставом ФКП "Армавирская биофабрика" является производство лекарственных средств ветеринарного применения для проведения противоэпизоотических мероприятий, находящихся в сфере национальных интересов Российской Федерации и обеспечения национальной безопасности, а также лекарственных средств для медицинского применения.
Лекарственные препараты выпускаются в соответствии с Правилами надлежащей производственной практики, утвержденными приказом Минпромторга РФ от 14. 06. 2013 №916 (Правила GMP). Предприятие получило сертификат GMP в декабре 2014 года.